Ayon kay Presidential Spokesman Salvador Panelo, bilang pinuno ng bansa ay tungkulin ng Pangulo na protektahan ang mga mamamayan.
Hindi naman aniya pinuwersa ng Pangulo ang mga taga hudikatura na payagang makaalis ng bansa si Misuari.
Paniwala ni Panelo, kung ang problema sa Mindanao ay nakasalalay sa katauhan ni Misuari na may hawak na malaking grupo at malakas ang impluwensya, tungkulin ng punong ehekutibo na gawin ang lahat ng kanyang makakaya na ipaalam sa hukuman na makatutulong ito para tuluyang umusad ang kapayapaan.
Katwiran pa ni Panelo, maaari kasing makatulong para maresolba ang problemang kapayapaan sa Mindanao kung luluwagan ng kaunti ang pakikitungo kay Misuari.
Si Misuari ay may warrant of arrest dahil sa kasong rebelyon bunsod ng Zamboanga siege noong 2013 at nahaharap din sa kasong graft at malversation dahil sa maanomalyang pagbili ng education materials noong siya pa ang governor ng Autonomous Region in Muslim Mindanao (ARMM).
Nasa Abu Dhabi at Morocco ngayon si Misuari dahil dumadalo sa mga international conference at inaasahang uuwi ng bansa sa March 20.
Una rito, inamin ng Pangulo na tinawagan niya ang ilang mga taga hudikatura at gumawa ng ilang arrangement para makalabas ng bansa si Misuari.